2  Einführung

Version vom August 23, 2023 um 17:58:31

• Grundlagen der klassischen, mendelschen Vererbung beinhaltend das Hardy-Weinberg-Gleichgewicht
• Grundlagen der Quantitativen Genetik mit Kopplungskarten und Linkage disequilibrium
• Genetische Distanz und polygenetische Bäume zur Darstellung evolutionärer Beziehungen
• Markergestützte Selektion und indirekte Selektion
• Statistische Herausforderungen von hochdimensionalen Daten
• Data Preprocessing und Qualitätskontrolle auf der Ebene der Marker und Individuen
• Gängige Assoziationstests unter anderem Chi-Quadrat-Test und logistische Regression
• Auswertung von Genomeweite Assoziationsstudien, Microarraydaten, High throughput genotyping, Next generation sequencing, Whole genome sequencing und RNA-seq an Fallbeispielen
• Visualisierungen der Ergebnisse durch Manhattanplot, Vucanoplot und Regional Association Plot und weiteren.
• Grundlagen Multiomics und Pathway Analysen sowie deren Datenbanken
• Grundlegende Methoden zum Sequenzaligment
• Anwendung der Algorithmen an ausgewählten Fallbeispielen in R/Bioconductor